Дюбуа исходил из положения, что психотерапия воздействует лишь при тех заболеваниях, к которым мозг якобы непричастен и которые являются, по его мнению, болезнями «духа».

В концепции Дюбуа «дух» не зависит от мозга, не зависит в основном также и от внешнего мира. Основные особенности «духа», по мнению Дюбуа, являются прирожденными. Он писал: «Ваш наследник, являясь в свет, владеет лишь тем, что вы ему дали; не упрекайте его за его убожество. Возьмите его таким, как он есть, с его скромным капиталом врожденных нравственных понятий… Вы можете вздыхать над неумолимой суровостью естественных законов наследственности, но не сваливайте тяжесть ответственности на несчастное существо, порожденное вами на свет божий. Вы должны стараться исправить воспитанном порочные наклонности, пробудить нравственные чувства, развить рассудок настолько, чтобы он мог сразу различать мотивы, определяющие поведение».

Психика человека здесь раздваивается: одна часть ее дастся человеку при рождении, определена наследственностью- это «врожденные нравственные понятия», другая разум; первая может изменяться в некоторой мере под влиянием убеждения- Поэтому и психотерапия, по теоретическим соображениям Дюбуа, должна сводиться к воздействию только на разум, противопоставленный другим сторонам психики.

Это положение, целиком опирающееся на функционалистскую психологию, рассматривавшую «функции» психики независимо и изолированно друг от друга, определяет существо теоретических позиций Дюбуа и его «рациональной психотерапии». Само название метода отражает его «функционалистскую» природу, противопоставляя разум всем другим сторонам психики.

Отрывая одни стороны психики от других, Дюбуа противопоставлял также психическое физиологическому и, исходя из такого противопоставления, критиковал, в частности, известную концепцию эмоций, разработанную Джемсом и Ланге, которая была для него слишком «физиологичной». Дюбуа высказывался против пользования медикаментозными и физическими методами при лечении больных неврозами.

Отметим еще, что невротик, согласно ложной концепции Дюбуа, оказывается весьма близким преступнику: оба вследствие отягченной наследственности антисоциальны, оба нуждаются в возможном выправлении врожденных пороков.